امروزه مؤثرترین روش درمان زگیل تناسلی، در دنیا فریز زگیل یا کرایوتراپی است. در این روش با ایجاد انجماد در دمای بسیار پایین (۱۹۶- درجه سانتیگراد) با نیتروژن مایع، زگیل کاملاً منجمد میشود. نیتروژن مایع تا عمق زگیل نفوذ میکند، تا تمام بافت زگیل فریز شود.
کرایو به عنوان یک روش بسیار مؤثر، کم هزینه و با اثر درمانی بسیار بالا جهت درمان زگیل تناسلی در مردان و زنان توصیه می شود. این روش از روش لیزر تراپی ارزان تر بوده و باعث پخش شدن زگیل تناسیلی به بخش های دیگر نمی شود.